藥物的發現是一項非常艱巨的工作，其需要化學家們從數百萬種化合物中篩選zui終尋找的那一個，而DNA技術或許就可以明顯加速藥物的發現之旅。

在麻省沃爾瑟姆市一個普通混凝土樓房二樓的實驗室冰箱中保存著一個具有明確標識的檢測管，該管中含有天文學數字尺度那么多的混合物，而這些眾多的化合物屬于制藥公司葛蘭素史克(GSK)所有，其中包含有1萬億個特殊的DNA標記的分子，其數量是銀河系中行星數量的10倍。

這些文庫可以幫助制藥公司和生物技術公司快速鑒別出可以和疾病蛋白配對的候選藥物，尤其是那些很難靶向作用的參與疾病的特殊蛋白質；藥物的發現通常都從科學家們開始組裝大量的化合物文庫開始，隨后研究者就會檢測這些化合物靶向作用蛋白的效力，這些化合物通常會被加入到每一個包含靶點的孔中來觀察是否化合物是否會影響這些靶點的活力，這種方法稱之為高通量篩選（high-throughput screening，HTS），其通常是利用機器人設備自動化地對數百萬種化合物進行檢測，但目前這種技術的花費非常昂貴，而且有時候并不總是會成功。

過去一些年里，藥物化學家已經通過利用條形碼樣的DNA來對化合物進行標記從而幫助發現更加有用且有效的化合物，這些DNA編碼的文庫通常會提供多種藥物尋找的優勢；這樣一來研究者們就會將所有DNA標記的分子置于單一的混合制劑中，隨后引入靶向蛋白，這樣一來結合靶向蛋白的任何一種化合物就會被輕松鑒別出來，而這都得感謝DNA條碼的幫助。1992年科學家們首先提出DNA編碼文庫，DNA編碼文庫并不會取代高通量篩查技術，很多制藥公司目前已經重金投資到了HTS中，而且利用DNA編碼技術有時候并不能合成一些化合物，但相比較而言DNA編碼技術卻會為科學家們提供一種快速、且廉價地尋找結合靶點的化合物的技術，比如泛蛋白連接酶，其會對蛋白進行標記并進行處理，同樣也可以在癌癥療法中被靶向標記。